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https://dspace.ufgd.edu.br/jspui/handle/123456789/384
Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.contributor.author | Shirakawa, Karina Tamie | - |
dc.date.accessioned | 2016-06-28T18:54:33Z | - |
dc.date.available | 2016-06-28T18:54:33Z | - |
dc.date.issued | 2014-12-12 | - |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/384 | - |
dc.description.abstract | O objetivo do presente trabalho foi realizar a identificação de peptídeos antimicrobianos no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. Basilisk utilizando ferramentas da Bioinformática, classificando os peptídeos antimicrobianos vegetais encontrados em famílias. Este trabalho visa fornecer informações sobre a espécie vegetal em análise e identificar os peptídeos antimicrobianos que possam ser utilizados como princípios ativos de fármacos ou como inseticidas, e em programas de melhoramento genético. O RNA foi extraído pela EMBRAPA Gado de Corte (Campo Grande, MS) e sequenciado pelo Beijing Genomics Institute, na China. O alinhamento dos transcritos únicos da planta foi realizado localmente utilizando o BLASTx pelo script BLASTall contra o banco de dados de peptídeos antimicrobianos CAMP. Os resultados foram organizados e analisados utilizando o MySQL, separando e contabilizando por taxonomia de origem, atividade antimicrobiana e família de peptídeos antimicrobianos. Do alinhamento obteve-se, inicialmente, 3.161 similaridades com 250 peptídeos antimicrobianos diferentes que, após a seleção manual, obteve-se 1.033 similaridades com 94 peptídeos antimicrobianos diferentes entre si. Os peptídeos antimicrobianos resultantes tinham principalmente atividade antibacteriana e antifúngica, pertencendo, principalmente, as famílias: taumatinas, snakins e defensinas, porém a maioria permaneceu como não definida pela classificação do CAMP. Os resultados obtidos demonstraram a diversidade do arsenal de defesa de U. decumbens cv. Basilisk. | pt_BR |
dc.language.iso | other | pt_BR |
dc.publisher | UFGD | pt_BR |
dc.subject | Braquiária | pt_BR |
dc.subject | Bioinformática | pt_BR |
dc.subject | Mecanismo de defesa vegetal | pt_BR |
dc.title | Análise do transcriptoma de Urochloa Decumbens (stapf) cv. Basilisk para a identificação de peptídeos antimicrobianos | pt_BR |
dc.title.alternative | Transcriptome analysis of Urochloa decumbens (stapf) cv. Basilisk to identify antimicrobial peptides | pt_BR |
dc.type | Working Paper | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Biotecnologia - Trabalho de Conclusão de Curso |
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Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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